Description
L'équipe du Pr Sébastien Lévesque est à la recherche d'une personne pour rejoindre son équipe dans le cadre d'un projet en génomique clinique financé par le ministère de la Santé et des Services Sociaux. Ce projet, intitulé « Optimisation de l'interprétation des données génomiques et le rendu clinique dans le réseau de la santé québécois grâce à une automatisation supervisée », vise à améliorer la plateforme bio-informatique de génomique clinique du Québec (CLIN). Le volet 2 du projet se concentre sur l'automatisation de l'interprétation des variations génétiques pour les maladies rares, en particulier par l'intégration et l'amélioration de notre outil bioinformatique PhenoVar de prédiction des diagnostics.
Responsabilités générales
1. Développement et intégration d'outils :
- Contribuer à l'intégration de l'outil PhenoVar dans la plateforme CLIN.
- Développer des API et autres solutions techniques pour faciliter l'automatisation des processus.
- Adapter et améliorer PhenoVar3 en fonction des nouvelles recommandations de l'American College of Medical Genetics and Genomics et intégrer des outils de recherche dans la littérature.
2. Validation à partir de données génomiques existantes :
- Valider le fonctionnement et la performance de PhenoVar une fois intégrer à la plateforme CLIN, comparativement aux autres outils de la plateforme CLIN, à partir de données génomiques standardisées avec diagnostic connus (benchmark).
3. Amélioration continue :
- Travailler à l'amélioration des outils et des pipelines d'analyse en fonction des besoins du projet et des retours des utilisateurs.
- Intégrer de nouvelles fonctionnalités et améliorer les capacités de prédiction des outils.
4. Documentation et communication :
- Documenter les processus, les analyses et les résultats de manière claire et concise.
- Communiquer régulièrement les progrès et les résultats du projet aux parties prenantes.
- Collaborer avec des équipes multidisciplinaires au CIUSSSE, et les partenaires au CHU Ste-Justine et au CHU de Québec.
À titre d'information
Emploi temporaire à temps complet, 35 heures par semaine.
Durée de l'emploi : un an.
Réception des candidatures
Veuillez faire parvenir votre curriculum vitae au Service des ressources humaines par voie électronique en cliquant sur le bouton «Postuler».
La date limite pour postuler est le 21 décembre 2025 à 17 h.
Nous remercions toutes les personnes candidates. Toutefois, nous communiquerons seulement avec les personnes retenues en entrevue.
